석사 전공이 달라져도 취업에 있어 어려움이 없을까요?

지금 현재 기계공학 학부를 나와서 석사를 신소재공학과로 진학을 할 예정인데, 정출연 연구소에서 파트타임으로 진학할 것 같습니다.
근데 현직자 선배 말로는 기계공학 전공을 살려서 석사 졸업을 하는게 대학원 학벌보다 더 중요하다고 하는데 어떻게 생각하시나요..
괜히 재료쪽으로 더 좋은 대학교(ky중 하나)이지만 취업때 단점으로 작용할까봐 걱정됩니다...