계약직 근무 중인 기업에 정규직 지원

6개월 계약직을 2개월 정도 근무했는데요, 해당 기업에 정규직 채용 공고가 떠서 지원해도 불이익이 없을지 문의드립니다.

우선 중견~대기업 정도 되는 기업이구요, 완전히 같은 직무는 아니지만 부서가 겹칩니다(정규직이 배정되는 다양한 부서 중 하나가 제가 계약직으로 일하는 부서). 가장 가고 싶은 기업인데 1년에 공채로 3명 정도 뽑는지라 서류부터 빡빡해서 몇년째 서류탈락을 했는데요.. 작년 합격자분이 저랑 같은 계약직을 했었던지라 희망을 갖고 있습니다. 그런데 2개월 밖에 근무하지 않았는데 공고가 났네요.. 

이 경우에 서류 심사에서 불이익이 있을까요? 제가 만약 합격이라도 하면 새로운 계약직을 뽑아야하니까 피하려나요... 당연히 지원은 하겠지만 불안한 마음에 여쭤봅니다.