학은제로 서성한중 일반 편입 공대 지원시 불이익

현재 부/경 공대 다니고 있는 학생입니다. 1학년 마치고 군입대를 하는데, 군대에서 편입 준비하려합니다. 자퇴는 안할 예정이라 군입대전까지 학은제로 학사따서 가려하는데, 경영학사를 따서 지원을 하는거라 비동일계에 학은제로 원서를 쓰는데 이러면 불이익이 큰지 궁금합니다... 어떤분 말로는 별 영향 없다하고, 어떤분 말로는 압도적인 점수 못받으면 힘들다라고 하시는데 뭐가 맞는걸까요?...